Comment augmenter la diversité du microbiome

Healthy gut microbiome with diverse beneficial bacteria

Révisé et rédigé médicalement par le Dr Zeeshan Afzal (MBBS), médecin-conseil chez Welzo. Dernière mise à jour : juillet 2026. Cet article est fourni à titre d'information générale et ne remplace pas un avis médical individuel.

Si vous souhaitez augmenter les bactéries intestinales diversité, le levier le plus fiable dont vous disposez est ce qui atterrit dans votre assiette au cours des prochaines semaines. Un microbiome intestinal plus diversifié – c’est-à-dire un plus grand nombre d’espèces bactériennes différentes, réparties plus uniformément – ​​est systématiquement associé à une meilleure santé métabolique, une fonction de barrière intestinaleplus forte, une réponse immunitaire mieux régulée et une plus grande résilience après une maladie ou des antibiotiques. En revanche, une faible diversité est une caractéristique récurrente de la dysbiose intestinale, des maladies inflammatoires de l'intestin, de l'obésité et du diabète de type 2.

Ce guide explique ce qu'est réellement la diversité du microbiome, ce qui l'érode et les étapes fondées sur des preuves qui l'augmentent - de l'objectif de 30 plantes par semaine aux aliments fermentés, aux fibres, à l'exercice et au sommeil. Vous découvrirez également où les suppléments ciblés sont réellement utiles. La gamme santé intestinale et la collection de probiotiques de Welzo comprennent plusieurs des catégories discutées ici, notamment Akkermansia muciniphila, poudre de pectine d'agrumes modifiée, Welzo Ultra Pureté Berbérine et Welzo Ultra Pureté TUDCA. Pour une vue d'ensemble, commencez par notre guide pilier sur la santé intestinale au Royaume-Uni et notre aperçu de la diversité du microbiome.

Table des matières

Ce que signifie réellement la diversité des bactéries intestinales

Illustration du microbiote intestinal humain montrant des bactéries colonisant le gros intestin

Image : illustration du microbiote intestinal, Wikimedia Commons, CC BY 4.0.

Le gros intestin adulte se situe quelque part dans l'ordre de 10 à 100 000 milliards de micro-organismes, couvrant des centaines d’espèces bactériennes ainsi que des archées, des champignons et des virus. La « diversité » est une mesure écologique spécifique de cette communauté – et non un terme vague de bien-être.

Diversité Alpha vs diversité bêta

Diversité Alpha décrit la variété au sein de votre propre intestin. C’est ce que rapportent la plupart des tests du microbiome, généralement sous la forme d’un indice de Shannon ou d’un décompte des espèces observées. Diversité bêta compare votre microbiome à celui de quelqu'un d'autre : elle mesure à quel point deux communautés sont différentes. Lorsque les gens parlent de vouloir augmenter la diversité des bactéries intestinales, ils veulent presque toujours dire augmenter la diversité alpha.

La richesse et l'uniformité

La diversité alpha a deux composantes. Richness est simplement le nombre d'espèces différentes présentes. Evenness est à quel point leurs chiffres sont équilibrés. Un intestin comprenant 200 espèces, dont trois dominent 80 % de la population, est en moins bonne santé qu'un intestin comprenant 200 espèces réparties de manière plus homogène. C'est pourquoi la prolifération d'un seul organisme – comme dans candida overgrowth ou SIBO – peut coïncider avec un microbiome techniquement « riche » mais fonctionnellement pauvre.

La diversité est un marqueur, pas l'objectif lui-même.

Il est important d'être précis ici, car beaucoup de marketing ne le sont pas. Une plus grande diversité est associée à de meilleurs résultats en matière de santé dans les études de population, mais elle est un indicateur de ce qui compte vraiment : une communauté microbienne ayant la capacité métabolique de fermenter les fibres, de produire des acides gras à chaîne courte, de maintenir la couche de mucus et de résister à la colonisation par des agents pathogènes. La diversité est l’empreinte de cette capacité, et non le mécanisme. Une personne qui se remet d'une infection grave peut présenter un pic de diversité temporaire qui ne signifie rien de bon.

Pourquoi augmenter la diversité des bactéries intestinales est important

Production d'acides gras à chaîne courte

Différentes bactéries fermentent différents substrats. Une communauté diversifiée peut décomposer une gamme plus large de fibres, produisant davantage d’acétate, de propionate et, surtout, de butyrate. Le butyrate est le principal carburant des colonocytes, les cellules qui tapissent votre côlon, et il aide à réguler l'inflammation et l'intégrité des jonctions serrées. Vous pouvez en savoir plus dans nos guides sur les acides gras à chaîne courte et butyrate suppléments.

Barrière intestinale et couche de mucus

Des organismes spécialisés tels que Akkermansia muciniphila vivent dans et maintenir la couche de mucus intestinal. Lorsque la diversité diminue, le maintien de la couche de mucus en souffre, ce qui est un mécanisme plausible à l’origine de l’augmentation de la perméabilité intestinale – le phénomène communément appelé fuite intestinale. Nous discutons honnêtement des preuves dans les fuites intestinales sont-elles réelles ? et fonction de barrière intestinale.

Régulation immunitaire et résistance à la colonisation

Une communauté dense et diversifiée occupe des niches écologiques et est en compétition pour les nutriments, ce qui rend la tâche plus difficile pour les agents pathogènes tels que Clostridioides difficile ou Salmonella à établir. C'est le principe derrière l'utilisation de probiotiques pour le risque C. diff et prévention de la diarrhée du voyageur. La diversité façonne également la tolérance immunitaire – voir santé intestinale et système immunitaire et santé intestinale et auto-immunité.

Liens métaboliques, hormonaux et santé mentale

Une diversité plus faible a été associée à plusieurs reprises à la résistance à l'insuline, à une graisse viscérale plus élevée et à des profils lipidiques défavorables. Il recoupe également la connexion intestin-cerveau, le métabolisme hormonal, la santé de la peau, le sommeil et la la régulation de la glycémie.

Ce qui réduit la diversité du microbiome.

Avant d'ajouter, cela vaut la peine de le supprimer. Ce sont les facteurs les mieux documentés de faible diversité.

Facteur Effet sur la diversité Que faire
Régime pauvre en fibres et ultra-transformé Affame les espèces fermentant les fibres ; réduit la richesse au fil du temps Augmenter les fibres et la variété des plantes — voir UPF et l'intestin
Antibiotiques Diminution brutale et parfois prolongée de la richesse Utiliser uniquement lorsque cela est indiqué ; voir probiotiques après les antibiotiques
IPP à long terme (par exemple oméprazole) Diversité de Shannon réduite ; les bactéries buccales apparaissent plus bas dans l'intestin Vérifiez la nécessité avec votre médecin généraliste - voir effets à long terme de l'oméprazole
Excès d'alcool Dysbiose, intégrité de la barrière réduite Rester dans les limites des directives britanniques (14 unités/semaine)
Stress chronique et mauvais sommeil Modifie la motilité, le flux biliaire et la composition de la communauté Voir nerf vague et intestin
Travail posté/perturbation circadienne Perturbe les rythmes microbiens diurnes Voir travail posté et digestion
Vieillissement Perte progressive de richesse après la quarantaine Voir santé intestinale et vieillissement
Régimes d'élimination restrictifs Moins de substrats, moins d'espèces Réintroduire systématiquement — voir Réintroduction du FODMAP

Deux d'entre eux méritent d'être soulignés. Premièrement, les antibiotiques : dans l’American Gut Project, les participants qui avaient pris des antibiotiques au cours du mois précédent avaient des microbiomes moins diversifiés que ceux qui n’en avaient pris aucun au cours de l’année précédente. Deuxièmement, la suppression de l’acide : une vaste étude jumelle et des méta-analyses ultérieures ont révélé une diversité microbienne plus faible chez les utilisateurs réguliers d’inhibiteurs de la pompe à protons, avec un épuisement des familles productrices d’acides gras à chaîne courte. Aucune de ces découvertes ne signifie que vous devez arrêter un médicament prescrit – cela signifie que la décision de continuer à long terme doit être une décision délibérée avec votre médecin. Des considérations similaires s'appliquent aux suppléments de metformine, AINS et fer..

12 Moyens fondés sur des preuves pour augmenter la diversité des bactéries intestinales

1. Mangez 30 plantes différentes ou plus par semaine

Panier de fruits et légumes mélangés représentant la diversité végétale pour la diversité des bactéries intestinales

Image : Panier de fruits et légumes, Wikimedia Commons, Public Domain Mark 1.0.

Il s'agit de l'intervention au rendement le plus élevé et de celle avec le signal le plus clair. L'American Gut Project — une étude scientifique citoyenne menée auprès de plus de 10 000 participants aux États-Unis, au Royaume-Uni et en Australie — a révélé que les personnes consommant plus de 30 types de plantes différents par semaine avaient des microbiomes intestinaux nettement plus diversifiés que celles qui en mangeaient 10 ou moins, et que cela était valable indépendamment du fait qu'elles s'identifiaient comme omnivores, végétariennes ou végétaliennes.

Ce qui compte comme un point végétal

Fruits, légumes, les céréales complètes, les légumineuses, les noix, les graines, les herbes et les épices comptent tous. Dans la pratique, différentes variétés d'une même espèce sont comptées séparément (oignon rouge ou oignon blanc, par exemple), alors qu'un aliment répété ne compte qu'une fois par semaine. Les herbes et les épices comptent pour un quart de point dans la plupart des versions du défi. Notre guide complet pour manger 30 plantes par semaine comprend un modèle de suivi et les meilleurs aliments pour la santé intestinale répertorie les ajouts à plus forte valeur ajoutée.

Le moyen le plus rapide d'y arriver

Mélanges de graines mélangées, haricots mélangés en conserve, mélanges de légumes surgelés et une épice rotative jar ajoutera 10 à 15 points par semaine pour très peu d'efforts ou de dépenses. Acheter un « mélange de quatre grains » au lieu d'un seul grain équivaut à quatre points au lieu d'un.

2. Atteignez 30 g de fibres par jour

Assortiment de légumes frais riches en fibres, notamment des poivrons, des tomates et des légumes-feuilles

Image : Mélange de légumes, Wikimedia Commons, CC BY 3.0.

Le Comité consultatif scientifique britannique sur la nutrition fixe l'objectif pour les adultes à 30 g de fibres par jour. La plupart d’entre nous sont loin d’être à la hauteur : les données d’une enquête nationale indiquent des apports moyens autour de 19 à 20 g, avec environ 9 % des adultes répondant à la recommandation. Cet écart est, en termes microbiens, une pénurie alimentaire chronique.

Variez le type, pas seulement la quantité

Différentes fibres nourrissent différents organismes, donc la variété compte autant que le nombre total de grammes. Inclure des fibres solubles/visqueuses (avoine, psyllium, pommes, pectine d'agrumes), des fibres insolubles (céréales complètes, peaux, noix), de l'amidon résistant (pomme de terre refroidie, riz et pâtes, banane verte) et des oligosaccharides fermentescibles (oignon, ail, poireau, racine de chicorée). Voir comment augmenter les fibres, aliments riches en fibres au Royaume-Uni et psyllium vs inuline.

Allez-y lentement si vous ballonnez

Augmenter les fibres de 5 g par semaine plutôt que d'un seul coup réduit considérablement les gaz et l'inconfort. Si les ballonnements persistent, lisez aliments qui provoquent des ballonnements et soulagement du vent emprisonné.

3. Ajoutez quotidiennement des aliments fermentés

Bol de choucroute, un aliment fermenté vivant qui soutient la diversité du microbiome intestinal

Image : Choucroute, Wikimedia Commons, CC BY-SA 3.0.

Un essai randomisé à la Stanford School of Medicine a assigné 36 adultes en bonne santé à un régime riche en aliments fermentés ou en fibres pendant 10 semaines. Le groupe des aliments fermentés a montré une augmentation de la diversité microbienne globale, avec des effets plus importants pour des portions plus importantes, ainsi qu'une diminution d'un ensemble de protéines inflammatoires. Notamment, le bras riche en fibres n’a pas augmenté la diversité au cours de cette période – les chercheurs ont conclu que l’augmentation seule de la fibre sur une courte période était insuffisante pour modifier la diversité.

Cela ne signifie pas que la fibre est sans importance ; cela signifie que les fibres agissent sur un horizon plus long et que les aliments fermentés agissent plus rapidement. Faites les deux. Visez 2 à 4 portions par jour de yaourt vivant, de kéfir, de choucroute, de kimchi, de miso, de tempeh ou de kombucha. Nos guides sur les aliments fermentés au Royaume-Uni et aliments fermentés par rapport aux probiotiques expliquent quels produits de supermarché sont réellement vivants.

4. Donnez la priorité aux aliments prébiotiques

Les prébiotiques sont les substrats que fermentent vos bactéries existantes. Les sources les plus riches sont les oignons, l'ail, les poireaux, les asperges, la racine de chicorée, le topinambour, les bananes légèrement vertes, l'avoine et l'orge. Voir aliments prébiotiques et prébiotique vs probiotique.

5. Inclure l'amidon résistant

La cuisson puis le refroidissement des féculents convertissent une partie de l'amidon en une forme qui résiste à la digestion et atteint le côlon intact, où il nourrit préférentiellement les producteurs de butyrate. Les pommes de terre, le riz, les pâtes et l’avoine cuits et refroidis sont tous admissibles – et le réchauffage n’annule pas l’effet. Lisez amidon résistant.

6. Mangez des aliments riches en polyphénols

Seulement environ un dixième des polyphénols alimentaires sont absorbés dans l'intestin grêle ; le reste atteint le côlon et est métabolisé par les bactéries intestinales en composés bioactifs. Les baies, l'huile d'olive extra vierge, le thé vert, le café, le cacao, les raisins rouges et les herbes sont les sources les plus denses. Voir polyphénols et santé intestinale.

7. Utilisez stratégiquement un probiotique multi-souches

Les probiotiques ne colonisent généralement pas de manière permanente et la plupart n'augmenteront pas directement votre score de diversité alpha. Ce qu’ils peuvent faire, c’est apporter un bénéfice fonctionnel transitoire : moduler l’immunité, produire des métabolites, entrer en compétition avec les agents pathogènes et favoriser la récupération après les antibiotiques. Les formulations multi-souches ont une couverture fonctionnelle plus large que les souches uniques ; voir probiotiques simples ou multi-souches, comment choisir un probiotique et parcourez la collection de probiotiques Welzo. Les guides spécifiques aux souches incluent Lactobacillus rhamnosus GG, Bifidobacterium longum, Lactobacillus plantarum, Bacillus coagulans et Saccharomyces boulardii.

8. Considérez les souches de nouvelle génération basées sur des spores

Akkermansia muciniphila est une espèce dégradant la mucine qui est généralement plus abondante chez les personnes qui font de l'exercice régulièrement et moins abondante en cas de maladie métabolique. Il se situe en dehors des catégories traditionnelles Lactobacillus/Bifidobacterium et est disponible en tant que supplément autonome d'Akkermansia. Comparez les approches en Akkermansia vs probiotiques, Akkermansia pasteurisé et probiotiques à base de spores.

9. Faites de l'exercice régulièrement - et continuez à le faire

Un travail transversal a été le premier à le signaler : les joueurs de rugby professionnels ont montré une plus grande diversité alpha que les témoins sédentaires appariés en termes d'âge et d'IMC, et les femmes physiquement actives ont des niveaux plus élevés de producteurs de butyrate tels que Faecalibacterium prausnitzii et Roseburia. hominis, et plus encore Akkermansia muciniphila. Une méta-analyse de 2024 de 25 études d'intervention sur l'exercice auprès de 1 044 participants a révélé une augmentation légère mais statistiquement significative de la diversité de Shannon avec l'exercice, avec des effets plus importants chez les femmes et les personnes âgées.

Deux mises en garde méritent d'être clairement énoncées. Les effets sont modestes et incohérents d’un essai à l’autre, et ils semblent s’inverser lorsque les personnes redeviennent sédentaires – la cohérence compte plus que l’intensité. Voir santé intestinale pour les athlètes et, si un entraînement intense vous dérange l'estomac, trots du coureur.

10. Protégez votre sommeil et votre rythme circadien

Les bactéries intestinales ont leurs propres rythmes quotidiens, entraînés en partie par l'horaire de vos repas. Un sommeil irrégulier et une alimentation tardive atténuent ces oscillations. Étapes pratiques : une heure de réveil constante, la lumière du jour le matin et un jeûne nocturne de 12 heures lorsque cela est possible. Voir santé intestinale et sommeil.

11. Gérer le stress chronique

Le stress modifie la motilité intestinale, les sécrétions et le flux biliaire, ce qui modifie l'environnement dans lequel vivent vos bactéries. La respiration, le temps passé à l'extérieur et les exercices structurés sont tous utiles via le tonus vagal - voir le nerf vague et l'intestin et probiotiques pour l'anxiété.

12. Sortez et réduisez la stérilité inutile

L'exposition microbienne environnementale (jardinage, contact avec le sol, présence d'animaux, temps passé dans un espace vert) est associée à une plus grande diversité microbienne. Laver les produits crus plutôt que de tout éplucher et éviter les produits antibactériens là où le savon ordinaire fera l'affaire sont des ajustements petits mais judicieux.

Un plan de diversité de 8 semaines

Semaines Focus Actions
1–2 Référence et victoires faciles Comptez votre usine actuelle points. Ajoutez un aliment fermenté par jour. Remplacez un grain raffiné par un grain entier. Considérez un test du microbiome intestinal pour une référence.
3–4 Construire des fibres Augmenter les fibres d'environ 5 g par semaine jusqu'à 30 g. Ajoutez des légumineuses trois fois par semaine. Introduire les féculents refroidis. Suivez la forme des selles à l'aide du Tableau des selles Bristol.
5–6 Élargissez la variété Poussez vers plus de 30 plantes par semaine. Ajoutez une deuxième portion fermentée quotidienne. Introduire des sources de polyphénols. Commencez ou augmentez l'exercice régulier.
7–8 Affinez et ciblez Traiter tout symptôme résiduel. Envisagez un probiotic, prebiotic ou un synbioticciblé. Refaites le test si vous avez défini une base de référence.

Si vous préférez un protocole structuré, consultez notre protocole de réinitialisation intestinale et le guide complémentaire sur augmenter la diversité des bactéries intestinales.

Suppléments qui soutiennent la diversité

Verre de kéfir, une boisson laitière fermentée vivante contenant plusieurs espèces de bactéries et de levures

Image : Kéfir, Wikimedia Commons, CC BY-SA 3.0.

Les suppléments sont un complément au régime alimentaire et non un substitut. Cela dit, plusieurs catégories ont une base de preuves raisonnable et une justification claire.

Catégorie Rationale Meilleur adapté à
Probiotiques multi-souches Support fonctionnel transitoire ; compétition avec les agents pathogènes Post-antibiotiques, voyages, IBS — voir meilleurs probiotiques UK
Fibres prébiotiques Alimenter les fermenteurs existants ; augmenter la production de SCFA Toute personne qui a du mal à obtenir 30 g de fibres provenant de la nourriture
Akkermansia muciniphila Spécialiste des couches de mucus ; faible taux de maladies métaboliques accent sur la santé métabolique, faible Akkermansia lors des tests
pectine d'agrumes modifiée fibres fermentescibles solubles provenant d'écorces d'agrumes ajout de fibres fermentescibles douces — voir MCP vs pectine
Butyrate Carburant direct des colonocytes Faible tolérance aux fibres, MII en rémission (avec apport clinique)
Berbérine Effets antimicrobiens et métaboliques Contextes de glycémie et de prolifération — voir interactions avec la berbérine
TUDCA Signalisation des acides biliaires et soutien hépatique Problèmes digestifs liés à la bile — voir Effets secondaires du TUDCA
Colostrum / zinc carnosine Soutien à l'intégrité de la muqueuse Protocoles axés sur les barrières — voir suppléments intestinaux qui fuient

Questions pratiques telles que quand prendre des probiotiques, combien de temps ils mettent à agir, s'ils ont besoin de réfrigération et CFU vs AFU sont traités en détail ailleurs sur le site. Les informations de sécurité sont disponibles sécurité des probiotiques et effets secondaires des probiotiques.

Comment mesurer vos progrès

Suivi des symptômes et des habitudes

Les mesures les moins chères et les plus utiles sont gratuites : décompte hebdomadaire des points de plantes, estimation quotidienne des fibres, forme et fréquence des selles, scores de ballonnements et énergie. La plupart des gens remarquent des changements avant qu'un marqueur de laboratoire ne bouge.

Tests du microbiome

Les tests de séquençage par les consommateurs rapportent la diversité alpha, les abondances relatives et parfois les estimations des producteurs de SCFA. Ils sont utiles pour suivre la direction du voyage au fil des mois, mais ne constituent pas un diagnostic, et les résultats varient d'un prestataire à l'autre et même d'un échantillon à l'autre. Comparez les options dans notre comparaison des tests de microbiome, guide britannique du test du microbiome intestinal et guide de test des selles.

Tests cliniques qui comptent plus

Si vous présentez des symptômes, les tests cliniquement validés sont plus informatifs que les scores de diversité : calprotectine fécale pour l'inflammation, sérologie cœliaque, H. pylori, Alcootest SIBO et un prélèvement sanguin général.

Combien de temps cela prend-il ?

Délai Qu'est-ce qui change généralement
24 à 72 heures Les abondances relatives commencent à changer en réponse à un changement alimentaire majeur
1 à 2 semaines Forme des selles, la régularité et le gaz se stabilisent souvent ; adaptation précoce à des aliments plus riches en fibres
4 à 10 semaines Un changement mesurable en matière de diversité est réaliste — l'essai sur les aliments fermentés de Stanford a duré 10 semaines
3 à 6 mois Restructuration communautaire plus durable ; fenêtre de nouveau test significative
6–12 mois+ La récupération après une exposition importante aux antibiotiques peut prendre autant de temps et peut être incomplète

Erreurs courantes à éviter

Chasser un numéro de diversité

Optimiser un résultat de test plutôt que vos symptômes et votre alimentation globale est une mauvaise utilisation des efforts. La diversité est un marqueur d'un écosystème fonctionnel, pas une cible en soi.

Augmenter la fibre trop rapidement

Passer de 15 g à 35 g du jour au lendemain produit de manière fiable des ballonnements et amène souvent les gens à abandonner l'ensemble du projet. Augmentez progressivement et buvez suffisamment de liquide.

Rester indéfiniment sur un régime pauvre en FODMAP

La phase d'élimination du régime faible en FODMAP est prévue pour durer 4 à 6 semaines. Une restriction prolongée réduit les substrats disponibles pour votre microbiome et peut réduire la diversité. La réintroduction est le point important - voir Réintroduction FODMAP et Types IBS.

En supposant que plus de probiotiques est meilleur

Un nombre plus élevé d'UFC n'est pas linéairement meilleur, et il existe une chose telle que trop de probiotiques. La sélection de la souche et les preuves de l’indication spécifique comptent plus que la dose. Voir aussi les probiotiques fonctionnent-ils ?

Ignorer les symptômes d'alerte tout en « travaillant sur l'intestin »

C'est le plus important, et il mène à la section suivante.

Quand consulter un médecin

L'amélioration de la diversité du microbiome est un objectif de bien-être, pas un traitement pour les personnes non diagnostiquées. maladie. Veuillez prendre rendez-vous d'urgence avec votre médecin généraliste - ne vous gérez pas vous-même avec un régime ou des suppléments - si vous présentez l'un des symptômes suivants :

  • Du sang dans vos selles ou des selles noires et goudronneuses
  • Perte de poids inexpliquée
  • Un changement persistant dans les habitudes intestinales durant plus de trois semaines, en particulier si vous avez plus de 50 ans
  • Difficulté à avaler ou persistance vomissements
  • Masses abdominales ou rectales, ou douleurs abdominales persistantes inexpliquées
  • Anémie ferriprive sans cause évidente
  • Des symptômes nocturnes qui vous réveillent ou de la fièvre accompagnée de douleurs abdominales
  • Des antécédents familiaux de cancer de l'intestin, de maladie coeliaque ou de maladie inflammatoire de l'intestin ainsi que de nouveaux symptômes

Voir quand consulter un médecin généraliste pour les symptômes de l'estomac et dépistage du cancer de l'intestin au Royaume-Uni. Si vous êtes enceinte, immunodéprimée, si vous avez un cathéter veineux central ou si vous avez une maladie diagnostiquée telle que maladie de Crohn ou colite ulcéreuse, discutez des probiotiques et des prébiotiques avec votre clinicien avant de commencer.

Foire aux questions Questions

Comment puis-je augmenter rapidement la diversité des bactéries intestinales ?

La voie la plus rapide, fondée sur des preuves, consiste à ajouter des aliments fermentés. Dans un essai randomisé de 10 semaines à Stanford, un régime riche en aliments fermentés a augmenté la diversité microbienne, des portions plus importantes produisant des effets plus forts. Combinez cela avec une augmentation constante vers 30 aliments végétaux différents par semaine, mais attendez-vous à un changement significatif au fil des semaines, et non des jours.

Qu'est-ce qu'un bon score de diversité du microbiome intestinal ?

Il n'y a pas de seuil universellement convenu, et les scores ne sont pas comparables entre les sociétés de test car elles utilisent des méthodes de séquençage et des bases de données de référence différentes. Ce qui est plus utile, c'est votre propre tendance au fil du temps sur le même test, interprétée en fonction de vos symptômes. Traitez n'importe quel chiffre avec prudence.

Les probiotiques augmentent-ils la diversité du microbiome ?

Généralement pas directement. La plupart des souches de probiotiques sont transitoires et ne colonisent pas de manière permanente, elles augmentent donc rarement la diversité alpha lors d'un test. Ils peuvent toujours apporter de réels avantages fonctionnels : favoriser la récupération après les antibiotiques, soulager certains symptômes du SCI et rivaliser avec les agents pathogènes. Les prébiotiques et la variété alimentaire sont les meilleurs outils pour la diversité elle-même.

Combien de temps faut-il pour augmenter la diversité des bactéries intestinales ?

La composition commence à changer dans les 24 à 72 heures suivant un changement alimentaire majeur, mais un changement de diversité mesurable et durable nécessite généralement 4 à 12 semaines d'alimentation constante. La récupération après une cure d'antibiotiques peut prendre six mois ou plus, et peut ne pas revenir complètement à la valeur de base.

Les fibres seules augmentent-elles la diversité des bactéries intestinales ?

Pas nécessairement sur de courtes périodes. L’essai de Stanford a révélé qu’un régime riche en fibres n’augmentait pas la diversité sur 10 semaines, bien qu’il produisait d’autres changements favorables. Les fibres restent essentielles à la production d'acides gras à chaîne courte et à la fonction microbienne à long terme - elles agissent simplement plus lentement que les aliments fermentés sur cette mesure particulière.

Les antibiotiques peuvent-ils réduire de façon permanente la diversité du microbiome ?

Une seule cure courte provoque généralement une baisse temporaire avec une récupération substantielle sur des semaines, voire des mois. Des traitements répétés ou à large spectre peuvent produire des réductions plus durables et certaines espèces peuvent ne pas revenir. Il est judicieux de favoriser la récupération avec des fibres, des aliments fermentés et des probiotiques appropriés – consultez notre guide sur les probiotiques après les antibiotiques.

L'exercice augmente-t-il la diversité des bactéries intestinales ?

Modestement. Une méta-analyse de 2024 de 25 études d'intervention a révélé une augmentation légère mais statistiquement significative de la diversité de Shannon avec l'exercice, avec des effets plus importants chez les femmes et les personnes âgées. Les athlètes présentent une plus grande diversité que les témoins sédentaires. Les effets semblent s'estomper si vous arrêtez, donc la cohérence compte plus que l'intensité.

Dois-je faire un test du microbiome avant d'apporter des modifications ?

Non. Les interventions qui favorisent la diversité – plus de plantes, plus de fibres, d’aliments fermentés, d’exercice, un meilleur sommeil – sont sûres et bénéfiques, quelle que soit votre situation de base. Un test est facultatif et très utile si vous souhaitez un objectif avant et après, ou si vous travaillez avec un clinicien sur un problème spécifique.

Peut-on avoir trop de diversité microbiologique ?

Une très grande diversité n'est pas automatiquement bonne. Cela peut parfois refléter une communauté instable ou une colonisation par des organismes qui n'appartiennent pas au côlon, et la diversité peut augmenter de manière transitoire au cours de la maladie. Une communauté stable et fonctionnelle produisant suffisamment d'acides gras à chaîne courte compte plus qu'un score élevé.

Quel changement unique fait la plus grande différence dans la diversité des bactéries intestinales ?

Augmenter la variété d'aliments végétaux que vous mangez, plutôt que la quantité de l'un d'entre eux. Les données de l’American Gut Project ont montré que les personnes mangeant plus de 30 types de plantes par semaine avaient des microbiomes plus diversifiés que celles qui en mangeaient moins de 10, indépendamment de leur régime alimentaire global. Si vous changez une chose, changez-la.

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  15. Qualité de l'alimentation et microbiote fécal chez les adultes dans le cadre de l'American Gut Project. The Journal of Nutrition. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022316623126216
  16. Microbiote intestinal pour la santé. Recommandations pratiques pour augmenter la diversité microbienne intestinale. https://www.gutmicrobiotaforhealth.com/practical-recommendations-to-increase-gut-microbial-diversity/
  17. UCLA Santé. Réinitialiser le microbiome intestinal est un projet à long terme. https://www.uclahealth.org/news/article/resetting-gut-microbiome-is-a-long-term-project

À propos de l'auteur

Dr Zeeshan Afzal (MBBS) est médecin qualifié et médecin-conseil chez Welzo, où il révise et rédige du contenu clinique sur la santé digestive, la nutrition et la médecine préventive. Il écrit en mettant l'accent sur la traduction de preuves évaluées par des pairs en conseils pratiques et sûrs pour les lecteurs britanniques.

Avis médical

Cet article est destiné à des fins éducatives générales et ne constitue pas un conseil médical, un diagnostic ou un traitement. Les interventions nutritionnelles et liées au mode de vie affectent les individus différemment. Parlez toujours à votre médecin généraliste, pharmacien ou diététiste avant de commencer un nouveau supplément, en particulier si vous êtes enceinte ou si vous allaitez, si vous êtes immunodéprimée, si vous prenez des médicaments sur ordonnance ou si vous vivez avec une maladie gastro-intestinale diagnostiquée. Si vous présentez l’un des symptômes d’alerte décrits ci-dessus, consultez rapidement un médecin. En cas d'urgence, appelez le 999 ou rendez-vous au service A&E le plus proche.

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